Крім переваг, селянсько-фермерське господарство має деякі мінуси. Тому при плануванні займатися сферою бізнесу потрібно ретельно проаналізувати її недоліки. Серед мінусів КФГ слід виділити:
Спочатку на дане господарство потрібні значні витрати. Приблизно через рік починає з’являтися прибуток, коли виростають тварини та птахи. В результаті на перший час мають бути гроші на особисті витрати. Сім’я має бути підготовленою до того, що спочатку доведеться нести лише витрати.
На господарство впливають негативні чинники довкілля. Цей бізнес має велику кількість природних шкідників. У результаті фермер може зазнати великих збитків. Причому це може статися миттєво. До цих явищ відносяться: зливи, посуха, шкідливі комахи, захворювання тварин тощо. буд.
Бізнес фермера є сезонним. Найбільше це стосується розведення рослин. Власник господарства отримує у році доходи лише один, двічі, коли збирає врожай. В решту часу він несе лише витрати. У зв’язку з цим фермер повинен вміло витрачати свої кошти. Йому потрібно розподіляти їх так, щоб вистачило на весь рік.
Для тих, хто займається господарством, важко отримати кредит. Це пов’язано з тим, що фінансові інститути неохоче видають кошти для таких господарств, оскільки дана сфера схильна до підвищеного ризику. Власник господарства має покладатися лише з власні фінанси.
Фермеру складно продати свою продукцію за доступною ціною. Процес продажу продукції фермерського господарства є досить складним процесом. Власник господарства стикається з бюрократичним впливом. Тому що необхідно отримувати різні довідки та сертифікати. Більшість фермерів продають свою продукцію за заниженою ціною перекупників і втрачають більшу частину прибутку.